本院以追求現代農業科技，發展精緻農業，達成促進農業生產、生活、生態永續經營利用之教育目標，並配合國家生物資源產業的發展需要，培育現代農業科技人才，並兼顧理論與實際之教學、研究與推廣服務為發展目標。基此，本院發展方向及重點如下：
- 積極鼓勵教師升等以提昇教學研究品質，預計三年後本院教授、副教授職級師資可達75%。
- 建構農業生物技術教學研究設備及加強生物技術之研究與發展，推動生技明星產業，期望發展成為我國農業生物技術教學及研發中心。
- 建立教師同仁學術研究評鑑及獎勵制度，積極提昇研究質與量。鼓勵教師到各研究所機構或國外大學做短期研究或進修。
- 加強學生專業基礎科目與實務操作、應用技能訓練，並結合區域性資源和需求，培養學生具有科技與人文素養兼具之人才，並獎勵學生出席國際研討會發表論文。
- 加強園藝技藝中心功能，除加強原有之教育訓練，協助提昇產業自動化、機械化、科技化外，並積極加強與產業建教合作、種苗生產及接受產業界委託研究計畫。
- 推動國際農業合作及辦理國際或國內農業有關研討會，邀請國內外專家學者與會，重視產學合作與實務經驗之充實，促進學術之交流，提升本院之學術地位。
