入學管道有推薦甄選與筆試入學。考生可依其專長選擇筆試科目:
甲組:工程數學、工程力學、英文
乙組:工程數學、自動控制、英文
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本所碩士班研究生依其研究領域必須選修相關課程24學分及專題討論,並完成論文一篇,通過論文口試後使能畢業,修業年限2~4年。
開授的課程有機械、電機領域的學科,以及跨領域的生醫工程,如有限元素分析、振動學、類比訊號處理、類神經網路、生物感測器、生物產品品質量測、生物系統環控工程、生物分子操作、生物微奈米概論等。
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