管理研究所博士班奉教育部核准於92學年度成立，為國內各大學第一個採DBA（Doctorate in Business Administration，仿哈佛管理學院之制度）學制規劃之博士班。
本所一般管理組之課程規劃係以企業管理機能與實作課題為導向，針對具有商管或相關領域碩士學位以上之畢業生施以三年至七年之專業教育，採培養高等管理教育師資與高級專業管理人才雙軌方向，以行銷管理、資訊管理、財務管理、策略管理為主軸方向，系統性培育管理專業研究人才；希望透過理論(課程結構)與實務(師資結構)的結合，能提供華人地區各產業所需之高階資深顧問師，並期能針對產業界提供專業(產、銷、人、發、財)的諮詢、相關政策的訂定以及政策的建言。因此，相較於一般Ph. D學制企管博士班所強調之數量或經濟導向課程，本所博士班實更貼近於高等管理教育師資與高級專業管理人才之需求。
休閒事業管理組課程設計以休閒相關理論發展為基礎，並以管理相關課程為輔；強調「以培養優秀休閒事業管理及研究人才」教學理念，整合各系所優秀師資，培育兼具深度與廣度能為學界及實務界所用之休閒事業管理人才。本所至97學年度起已停止招生休閒事業管理組博士班。