配合本校整併宗旨以「光耀嘉義，揚名全國，躋身國際」發展成為一所具有國際水準的綜合大學為指標，整體發展計畫之目標如下：
一、營造充滿關懷、溫馨、安全、和諧具有人性化與新希望的校園。
二、建構科技化、資訊化的校園，提高教學品質。
三、開放參與營造有效率的校務運作功能。
四、發展與充實學生多元知能，具備挑戰能耐與競爭力。
五、追求卓越、多元與創新，倡導學術責任，展現高等學府新風貌。
六、爭取校友認同支持，增進社區服務。
七、加強學術交流與合作，躋身國際殿堂。
配合雲嘉南地區為臺灣畜牧業重鎮，以飼養經濟動物為主之特點，結合鄰近地區之豐富資源，強化培育相關動物類別之臨床獸醫師、加強動物疾病診斷與藥物殘留檢測技術。除以本校獸醫學院附設動物醫院與動物疾病診斷中心作為教學實習場域，並透過產學合作促進學理與實務結合，同時設有碩士班學制，以培育高等獸醫學研究人才與臨床獸醫師。